1991 yılında Orta Doğu Teknik Üniversitesi Elektrik ve Elektronik Mühendisliği Bölümünden mezun olmuştur. Yine aynı üniversiteden 1994 yılında yüksek lisans diplomasını alan Muzaffer Şentürk 20 yılı aşkın bir süredir sağlık bilişimi alanında hizmet vermektedir.
Profesyonel hayatında uzun yıllar Sağlık Bakanlığı bünyesinde Sağlık Bilişimi danışmanı olarak görev alan Muzaffer Şentürk, bunun yanısıra ülkemizdeki Sağlık Bilişimi Firmalarında da üst düzey yöneticilikler gerçekleştirmiştir. Sağlık Bakanlığı PPP projelerinde HBYS danışmanlığı yapmış, projelerin planlama çalışmalarında bizzat görev almıştır.
Hem ülkemizde ve hem de bölge coğrafyada (Suudi Arabistan, Rusya, Bulgaristan, Romanya, Irak, Pakistan vb) ulusal sağlık bilgi sistemleri projelerinin planlama, tasarım ve uygulama aşamalarında üst düzey sorumluluklar gerçekleştirmiş olan Muzaffer Şentürk halen HOM danışmanlık firması üzerinden Etlik PPP projesindeki danışman ekibin yönetimi ile HAVELSAN A.Ş. Sağlık Grubu yöneticiliklerini sürdürmektedir.